Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN1

Arrdc1, Arrestin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arrdc1Q99KN1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Arrdc1Q99KN1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arrdc1Q99KN1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arrdc1Q99KN1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arrdc1Q99KN1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arrdc1Q99KN1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arrdc1Q99KN1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Arrdc1Q99KN1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arrdc1Q99KN1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arrdc1Q99KN1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Arrdc1Q99KN1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Arrdc1Q99KN1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Arrdc1Q99KN1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arrdc1Q99KN1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arrdc1Q99KN1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Arrdc1Q99KN1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Arrdc1Q99KN1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Arrdc1Q99KN1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Arrdc1Q99KN1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arrdc1Q99KN1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arrdc1Q99KN1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arrdc1Q99KN1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arrdc1Q99KN1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Arrdc1Q99KN1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Arrdc1Q99KN1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Arrdc1Q99KN1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arrdc1Q99KN1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Arrdc1Q99KN1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Arrdc1Q99KN1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arrdc1Q99KN1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arrdc1Q99KN1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arrdc1Q99KN1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arrdc1Q99KN1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arrdc1Q99KN1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arrdc1Q99KN1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arrdc1Q99KN1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arrdc1Q99KN1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arrdc1Q99KN1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arrdc1Q99KN1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arrdc1Q99KN1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Arrdc1Q99KN1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arrdc1Q99KN1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arrdc1Q99KN1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arrdc1Q99KN1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arrdc1Q99KN1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arrdc1Q99KN1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arrdc1Q99KN1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arrdc1Q99KN1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arrdc1Q99KN1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arrdc1Q99KN1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Arrdc1Q99KN1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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