Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tlcd1Q99JT6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tlcd1Q99JT6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tlcd1Q99JT6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tlcd1Q99JT6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tlcd1Q99JT6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tlcd1Q99JT6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tlcd1Q99JT6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tlcd1Q99JT6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tlcd1Q99JT6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tlcd1Q99JT6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tlcd1Q99JT6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tlcd1Q99JT6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tlcd1Q99JT6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlcd1Q99JT6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlcd1Q99JT6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlcd1Q99JT6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlcd1Q99JT6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlcd1Q99JT6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlcd1Q99JT6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlcd1Q99JT6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlcd1Q99JT6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlcd1Q99JT6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlcd1Q99JT6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tlcd1Q99JT6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms