Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms