Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spef1Q99JL1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms