Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms