Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctu1Q99J10 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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