Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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