Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms