Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrif1Q923B3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms