Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms