Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Afg3l1Q920A7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.3 ms