Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cts3Q91ZD5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms