Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms