Protein–RNA interactions for Protein: Q91WS2

Nlrp6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp6Q91WS2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp6Q91WS2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp6Q91WS2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp6Q91WS2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp6Q91WS2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp6Q91WS2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp6Q91WS2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp6Q91WS2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp6Q91WS2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp6Q91WS2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp6Q91WS2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp6Q91WS2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp6Q91WS2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp6Q91WS2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp6Q91WS2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp6Q91WS2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp6Q91WS2 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp6Q91WS2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp6Q91WS2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp6Q91WS2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp6Q91WS2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp6Q91WS2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp6Q91WS2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp6Q91WS2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp6Q91WS2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp6Q91WS2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms