Protein–RNA interactions for Protein: Q91WB7

Ubtd1, Ubiquitin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtd1Q91WB7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms