Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp3Q91W36 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp3Q91W36 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp3Q91W36 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp3Q91W36 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp3Q91W36 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp3Q91W36 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp3Q91W36 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp3Q91W36 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp3Q91W36 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp3Q91W36 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp3Q91W36 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp3Q91W36 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp3Q91W36 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp3Q91W36 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp3Q91W36 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp3Q91W36 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp3Q91W36 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp3Q91W36 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp3Q91W36 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp3Q91W36 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp3Q91W36 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp3Q91W36 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp3Q91W36 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp3Q91W36 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp3Q91W36 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp3Q91W36 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp3Q91W36 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp3Q91W36 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms