Protein–RNA interactions for Protein: Q91W29

Cox4i2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i2Q91W29 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox4i2Q91W29 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms