Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng8Q8VHW2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms