Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms