Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc71Q8VEG0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc71Q8VEG0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc71Q8VEG0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc71Q8VEG0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc71Q8VEG0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc71Q8VEG0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc71Q8VEG0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc71Q8VEG0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc71Q8VEG0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc71Q8VEG0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc71Q8VEG0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc71Q8VEG0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc71Q8VEG0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc71Q8VEG0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc71Q8VEG0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc71Q8VEG0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc71Q8VEG0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc71Q8VEG0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc71Q8VEG0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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