Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Cul7Q8VE73 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms