Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d2Q8VD57 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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