Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn4Q8VCH8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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