Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW8

Ttc36, Tetratricopeptide repeat protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc36Q8VBW8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc36Q8VBW8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc36Q8VBW8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms