Protein–RNA interactions for Protein: Q8R5M0

Gipc3, PDZ domain-containing protein GIPC3, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc3Q8R5M0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gipc3Q8R5M0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms