Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf3Q8R3J4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms