Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnaaf4Q8R368 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms