Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1B8

Rorb, Nuclear receptor ROR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorbQ8R1B8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RorbQ8R1B8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RorbQ8R1B8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RorbQ8R1B8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RorbQ8R1B8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RorbQ8R1B8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RorbQ8R1B8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RorbQ8R1B8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms