Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hecw1Q8K4P8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms