Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MyripQ8K3I4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MyripQ8K3I4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MyripQ8K3I4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MyripQ8K3I4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MyripQ8K3I4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MyripQ8K3I4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MyripQ8K3I4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MyripQ8K3I4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MyripQ8K3I4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MyripQ8K3I4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MyripQ8K3I4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MyripQ8K3I4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MyripQ8K3I4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MyripQ8K3I4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MyripQ8K3I4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MyripQ8K3I4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MyripQ8K3I4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MyripQ8K3I4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MyripQ8K3I4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms