Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdk5rap2Q8K389 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms