Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms