Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms