Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brd3Q8K2F0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms