Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms