Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1eQ8K202 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms