Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prkd3Q8K1Y2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms