Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh3Q8K1E6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms