Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34c1Q8K193 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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