Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700001C19RikQ8K168 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
1700001C19RikQ8K168 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700001C19RikQ8K168 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700001C19RikQ8K168 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700001C19RikQ8K168 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700001C19RikQ8K168 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700001C19RikQ8K168 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700001C19RikQ8K168 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700001C19RikQ8K168 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700001C19RikQ8K168 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700001C19RikQ8K168 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
1700001C19RikQ8K168 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700001C19RikQ8K168 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700001C19RikQ8K168 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700001C19RikQ8K168 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700001C19RikQ8K168 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700001C19RikQ8K168 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
1700001C19RikQ8K168 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700001C19RikQ8K168 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700001C19RikQ8K168 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700001C19RikQ8K168 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700001C19RikQ8K168 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700001C19RikQ8K168 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700001C19RikQ8K168 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700001C19RikQ8K168 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms