Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem17Q8K0U3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem17Q8K0U3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms