Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkn3Q8K045 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms