Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwnkQ8CIW5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TwnkQ8CIW5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms