Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms