Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Hpf1Q8CFE2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Hpf1Q8CFE2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Hpf1Q8CFE2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Hpf1Q8CFE2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Hpf1Q8CFE2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Hpf1Q8CFE2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Hpf1Q8CFE2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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