Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms