Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrrc9Q8CDN9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms