Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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