Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8CC96 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8CC96 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8CC96 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8CC96 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8CC96 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8CC96 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8CC96 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8CC96 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8CC96 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8CC96 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8CC96 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8CC96 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8CC96 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8CC96 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8CC96 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8CC96 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8CC96 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8CC96 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8CC96 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8CC96 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8CC96 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8CC96 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8CC96 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8CC96 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8CC96 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8CC96 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q8CC96 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q8CC96 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Q8CC96 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q8CC96 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q8CC96 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q8CC96 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Q8CC96 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q8CC96 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Q8CC96 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Q8CC96 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q8CC96 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q8CC96 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q8CC96 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q8CC96 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q8CC96 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8CC96 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8CC96 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8CC96 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8CC96 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8CC96 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8CC96 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8CC96 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8CC96 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8CC96 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8CC96 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8CC96 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8CC96 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8CC96 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8CC96 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8CC96 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8CC96 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8CC96 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8CC96 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8CC96 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8CC96 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8CC96 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8CC96 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8CC96 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8CC96 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8CC96 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8CC96 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8CC96 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8CC96 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8CC96 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8CC96 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8CC96 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8CC96 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8CC96 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8CC96 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8CC96 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8CC96 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8CC96 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8CC96 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8CC96 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8CC96 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8CC96 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8CC96 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q8CC96 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q8CC96 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q8CC96 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q8CC96 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q8CC96 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q8CC96 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q8CC96 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q8CC96 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q8CC96 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q8CC96 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q8CC96 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q8CC96 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q8CC96 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q8CC96 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q8CC96 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Q8CC96 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms