Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY8

Dctn4, Dynactin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn4Q8CBY8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn4Q8CBY8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn4Q8CBY8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms